MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 plasmid pRIV7116.01

Total Repeats: 444

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019679	AAGA	2	8	79	86	75 %	0 %	25 %	0 %	427740401
2	NC_019679	CGTTGT	2	12	110	121	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	427740401
3	NC_019679	TGT	2	6	241	246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740401
4	NC_019679	TCT	2	6	265	270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740401
5	NC_019679	TGTCG	2	10	345	354	0 %	40 %	40 %	20 %	427740401
6	NC_019679	CTA	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740401
7	NC_019679	CTA	2	6	371	376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740401
8	NC_019679	TTTG	2	8	416	423	0 %	75 %	25 %	0 %	427740401
9	NC_019679	GTT	2	6	450	455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740401
10	NC_019679	CTT	2	6	488	493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740401
11	NC_019679	CCT	2	6	538	543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427740401
12	NC_019679	ATC	2	6	558	563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740401
13	NC_019679	GCC	2	6	583	588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427740401
14	NC_019679	ACC	3	9	642	650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740401
15	NC_019679	TTG	2	6	741	746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740401
16	NC_019679	T	6	6	801	806	0 %	100 %	0 %	0 %	427740401
17	NC_019679	CT	3	6	821	826	0 %	50 %	0 %	50 %	427740401
18	NC_019679	TGTT	2	8	886	893	0 %	75 %	25 %	0 %	427740402
19	NC_019679	A	6	6	980	985	100 %	0 %	0 %	0 %	427740402
20	NC_019679	CTT	3	9	1041	1049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740403
21	NC_019679	TCG	2	6	1076	1081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427740403
22	NC_019679	TGCG	2	8	1168	1175	0 %	25 %	50 %	25 %	427740403
23	NC_019679	CTT	2	6	1176	1181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740403
24	NC_019679	TCC	2	6	1316	1321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427740404
25	NC_019679	AAT	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740404
26	NC_019679	TCT	2	6	1423	1428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740404
27	NC_019679	TATT	2	8	1444	1451	25 %	75 %	0 %	0 %	427740404
28	NC_019679	GTT	2	6	1524	1529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740405
29	NC_019679	T	6	6	1572	1577	0 %	100 %	0 %	0 %	427740405
30	NC_019679	ATTT	2	8	1588	1595	25 %	75 %	0 %	0 %	427740405
31	NC_019679	GAA	2	6	2149	2154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740406
32	NC_019679	ACA	2	6	2202	2207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427740407
33	NC_019679	AGC	2	6	2278	2283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740407
34	NC_019679	TGA	2	6	2371	2376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740407
35	NC_019679	TGA	2	6	2425	2430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740407
36	NC_019679	AGA	2	6	2446	2451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740407
37	NC_019679	TTC	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740408
38	NC_019679	ATGTAG	2	12	2745	2756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740408
39	NC_019679	GAA	2	6	2813	2818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740408
40	NC_019679	CAT	2	6	2849	2854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740408
41	NC_019679	GAA	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740408
42	NC_019679	TA	3	6	2918	2923	50 %	50 %	0 %	0 %	427740408
43	NC_019679	AAT	2	6	2950	2955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740408
44	NC_019679	TAA	2	6	2959	2964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740408
45	NC_019679	AAG	2	6	2971	2976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740408
46	NC_019679	AGA	2	6	2986	2991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740408
47	NC_019679	TAA	2	6	3006	3011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740408
48	NC_019679	AT	3	6	3014	3019	50 %	50 %	0 %	0 %	427740408
49	NC_019679	TAT	2	6	3026	3031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740408
50	NC_019679	AAT	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740408
51	NC_019679	TGA	2	6	3043	3048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740408
52	NC_019679	A	11	11	3088	3098	100 %	0 %	0 %	0 %	427740408
53	NC_019679	AAAT	2	8	3119	3126	75 %	25 %	0 %	0 %	427740408
54	NC_019679	AT	3	6	3339	3344	50 %	50 %	0 %	0 %	427740409
55	NC_019679	A	6	6	3389	3394	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
56	NC_019679	ATT	3	9	3438	3446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740409
57	NC_019679	A	6	6	3459	3464	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
58	NC_019679	TAG	2	6	3475	3480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740409
59	NC_019679	AC	3	6	3655	3660	50 %	0 %	0 %	50 %	427740409
60	NC_019679	A	6	6	3665	3670	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
61	NC_019679	GTA	2	6	3678	3683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740409
62	NC_019679	TAAAC	2	10	3698	3707	60 %	20 %	0 %	20 %	427740409
63	NC_019679	A	6	6	3708	3713	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
64	NC_019679	A	8	8	3728	3735	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
65	NC_019679	TTAT	2	8	3740	3747	25 %	75 %	0 %	0 %	427740409
66	NC_019679	TAG	2	6	3767	3772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740409
67	NC_019679	AGCTAC	2	12	3926	3937	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	427740409
68	NC_019679	AAT	2	6	3945	3950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740409
69	NC_019679	A	6	6	4006	4011	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
70	NC_019679	TAA	2	6	4042	4047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740409
71	NC_019679	TGTAAA	2	12	4118	4129	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	427740409
72	NC_019679	GGA	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427740409
73	NC_019679	AAAAG	2	10	4162	4171	80 %	0 %	20 %	0 %	427740409
74	NC_019679	TAT	2	6	4178	4183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740409
75	NC_019679	ATA	2	6	4194	4199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740409
76	NC_019679	T	6	6	4458	4463	0 %	100 %	0 %	0 %	427740410
77	NC_019679	T	8	8	4465	4472	0 %	100 %	0 %	0 %	427740410
78	NC_019679	GTA	2	6	4490	4495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740410
79	NC_019679	TAC	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740410
80	NC_019679	AAGT	2	8	4562	4569	50 %	25 %	25 %	0 %	427740410
81	NC_019679	TACT	2	8	6118	6125	25 %	50 %	0 %	25 %	427740411
82	NC_019679	CCCTAT	2	12	6145	6156	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	427740411
83	NC_019679	GTA	2	6	6163	6168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740411
84	NC_019679	TAC	2	6	6193	6198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740411
85	NC_019679	A	8	8	6216	6223	100 %	0 %	0 %	0 %	427740411
86	NC_019679	A	6	6	6225	6230	100 %	0 %	0 %	0 %	427740411
87	NC_019679	ATT	2	6	6240	6245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740411
88	NC_019679	A	6	6	6265	6270	100 %	0 %	0 %	0 %	427740412
89	NC_019679	T	6	6	6271	6276	0 %	100 %	0 %	0 %	427740412
90	NC_019679	A	7	7	6326	6332	100 %	0 %	0 %	0 %	427740412
91	NC_019679	GGCA	2	8	6353	6360	25 %	0 %	50 %	25 %	427740412
92	NC_019679	GTA	2	6	6401	6406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740412
93	NC_019679	CCA	2	6	6417	6422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740412
94	NC_019679	CAA	2	6	6434	6439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427740412
95	NC_019679	GGTA	2	8	6480	6487	25 %	25 %	50 %	0 %	427740412
96	NC_019679	T	7	7	6526	6532	0 %	100 %	0 %	0 %	427740413
97	NC_019679	TAA	2	6	6552	6557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740413
98	NC_019679	GCA	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740413
99	NC_019679	GCT	2	6	6678	6683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427740413
100	NC_019679	AAG	2	6	6733	6738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740413
101	NC_019679	T	7	7	6791	6797	0 %	100 %	0 %	0 %	427740413
102	NC_019679	TAA	2	6	6812	6817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740413
103	NC_019679	AT	3	6	6843	6848	50 %	50 %	0 %	0 %	427740413
104	NC_019679	AAT	2	6	6883	6888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740413
105	NC_019679	CAGTA	2	10	6899	6908	40 %	20 %	20 %	20 %	427740413
106	NC_019679	TAT	2	6	6932	6937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740413
107	NC_019679	AAG	2	6	6952	6957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740413
108	NC_019679	CAT	2	6	6965	6970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740413
109	NC_019679	GAT	2	6	7050	7055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740413
110	NC_019679	CAAA	2	8	7077	7084	75 %	0 %	0 %	25 %	427740413
111	NC_019679	GTT	2	6	7168	7173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740413
112	NC_019679	GA	3	6	7199	7204	50 %	0 %	50 %	0 %	427740413
113	NC_019679	TTC	2	6	7205	7210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740413
114	NC_019679	ATC	2	6	7492	7497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740414
115	NC_019679	GAG	2	6	7511	7516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427740414
116	NC_019679	AGC	2	6	7557	7562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740414
117	NC_019679	AAT	2	6	7580	7585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740414
118	NC_019679	CAG	2	6	7607	7612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740414
119	NC_019679	CAATC	2	10	7760	7769	40 %	20 %	0 %	40 %	427740414
120	NC_019679	ATTC	2	8	7790	7797	25 %	50 %	0 %	25 %	427740414
121	NC_019679	T	6	6	7800	7805	0 %	100 %	0 %	0 %	427740414
122	NC_019679	ATTTA	2	10	7806	7815	40 %	60 %	0 %	0 %	427740414
123	NC_019679	GGA	2	6	7816	7821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427740414
124	NC_019679	TTA	2	6	7825	7830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740414
125	NC_019679	AGC	2	6	7863	7868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740414
126	NC_019679	AGC	2	6	7884	7889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740414
127	NC_019679	CAA	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427740414
128	NC_019679	TTAT	2	8	8244	8251	25 %	75 %	0 %	0 %	427740415
129	NC_019679	CAC	2	6	8261	8266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740415
130	NC_019679	CTT	2	6	8326	8331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740415
131	NC_019679	TTCA	2	8	8367	8374	25 %	50 %	0 %	25 %	427740415
132	NC_019679	CAG	2	6	8405	8410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740415
133	NC_019679	T	6	6	8412	8417	0 %	100 %	0 %	0 %	427740415
134	NC_019679	AGCTTT	2	12	8595	8606	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	427740416
135	NC_019679	CTT	2	6	8615	8620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740416
136	NC_019679	CCA	2	6	8723	8728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740416
137	NC_019679	T	6	6	8791	8796	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
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397	NC_019679	CTTTA	2	10	23842	23851	20 %	60 %	0 %	20 %	427740430
398	NC_019679	TGG	2	6	23865	23870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427740430
399	NC_019679	GTT	2	6	23928	23933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740430
400	NC_019679	ATG	2	6	23978	23983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740430
401	NC_019679	GTTG	2	8	23989	23996	0 %	50 %	50 %	0 %	427740430
402	NC_019679	ACA	2	6	24538	24543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427740431
403	NC_019679	TGA	2	6	24629	24634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740431
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407	NC_019679	TTGG	2	8	24787	24794	0 %	50 %	50 %	0 %	427740431
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431	NC_019679	ATT	2	6	25894	25899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740431
432	NC_019679	GAGTA	2	10	25938	25947	40 %	20 %	40 %	0 %	427740431
433	NC_019679	ATT	2	6	25957	25962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740431
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